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近年来,受大语言模型和视觉基础模型成功经验的推动,单细胞基础模型(Single-Cell Foundation Models, scFMs)迅速发展,其预训练数...
单细胞测序技术能够提供细胞状态的静态快照,但如何从这些静态数据中重建细胞动态演化过程仍是基因组学领域的重要挑战。研究人员开发了ArchVelo,一种基于单细胞染...
肾脏肿块的无创精准评估长期以来是泌尿肿瘤学面临的重要挑战。由于影像学判断存在主观性、穿刺活检具有侵入性且容易受到肿瘤异质性的影响,大量良性或低侵袭性肿瘤患者仍接...
近年来,序列到功能(Sequence-to-Function, S2F)深度学习模型被视为理解基因调控机制的重要工具。这类模型能够直接从DNA序列预测基因表达等...
本文介绍一篇来自浙江大学侯廷军教授、李丹教授团队发表在Nature Communications的研究论文,题为“Targeting the intrinsic...
随着人工智能逐渐进入临床实践,生物医学图像分析不仅需要高准确率,更需要能够向医生清晰展示诊断依据。然而,目前大多数医学视觉语言模型虽然能够生成诊断结论,却无法准...
分子结构解析是化学研究中最基础也最具挑战性的任务之一。传统结构解析通常需要研究人员综合核磁共振(NMR)、红外光谱(IR)、质谱(MS)等多种实验数据,并结合丰...
核磁共振(NMR)谱学是解析分子结构最重要的实验技术之一,但复杂谱图的解读长期依赖经验丰富的专家,通过结合多种谱学特征和启发式规则逐步推断结构。尽管近年来深度学...
蛋白质结构基序是由少量空间上特定排列的残基组成的保守三维结构单元,往往与蛋白稳定性、配体结合以及催化活性密切相关。随着AlphaFold2及相关深度学习模型的发...
晶体结构的准确表征是推动机器学习应用于大规模晶体材料模拟的关键。然而,如何有效捕获并利用晶体结构复杂的几何与拓扑特征,仍然是当前晶体性质预测领域面临的重要挑战。...
单细胞扰动预测旨在学习细胞在药物处理、基因编辑或其他外界干预后的状态变化规律,是精准医疗和药物发现的重要研究方向。然而,单细胞测序具有破坏性特点,同一个细胞无法...
无机材料是能源存储、半导体制造、碳捕获和催化等众多关键技术的基础。然而,新材料发现面临极其庞大的化学空间,传统密度泛函理论(DFT)计算虽然准确,但计算成本高昂...
随着英国生物样本库(UK Biobank)、All of Us等大型队列项目陆续完成全基因组测序(WGS),研究人员开始能够系统分析稀有变异在复杂疾病和性状中的...
过去十多年里,“AI改变药物研发”几乎成为生物医药领域最热门的话题之一。然而现实并不总是如宣传般美好。许多早期AI制药公司未能兑现承诺,大量项目停留在概念验证阶...
分子动力学模拟是理解凝聚态体系结构与性质的重要工具,在电池电解液设计、绿色溶剂开发和材料筛选等领域发挥着核心作用。然而,如何仅依赖量子力学计算,在不借助实验参数...
基于结构的药物发现(Structure-Based Drug Design, SBDD)近年来受益于生成式人工智能的发展,尤其是扩散模型和流匹配模型在三维配体生...
RT-qPCR(逆转录定量PCR)是生命科学研究中最广泛使用的基因表达检测技术之一。然而,即使经过严格设计,引物仍然可能出现非特异扩增、扩增效率低下以及实验重复...
在单细胞转录组研究中,基因的高表达并不一定意味着其在细胞功能中真正重要。例如,许多关键转录因子表达量较低,而核糖体或线粒体基因虽然高度表达,却未必决定细胞身份。...
适应性免疫系统通过B细胞和T细胞对抗原的精准识别,为机体提供长期且高度特异性的免疫保护。然而,突变如何改变这些免疫识别过程中的分子互作,仍然是免疫学与计算生物学...
现代科学研究正在以前所未有的速度产生海量数据与复杂知识,但与此同时,科学界也正在不断丢失那些本不该失去的重要知识。大量阴性结果从未发表,研究人员多年积累的经验会...
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