Baidoa, hovedby i det sydvestlige Somalia; 157.500 indb. (2000). Byen ligger i et højtliggende og forholdsvis frugtbart område, Bayregionen, mellem floderne Juba og Shebelle. Området bebos af agerdyrkende stammer, rahawein, og nomader, hawiye. I 1992 medførte streng tørke og borgerkrig omfattende hungersnød og død blandt de 300.000 mennesker, der opholdt sig i byen. For at sikre nødhjælpsforsyningerne invaderede amerikanske og franske styrker under FN-flag området. Byen var i 2006 midlertidigt hovedsæde for den somaliske overgangsregering, udpeget i 2004, der oprindeligt havde sæde i Kenya, men endnu ikke kunne flytte til Mogadishu pga. sikkerhedssituationen. Baidoa blev i 2014 hovedstad i delstaten Somalias Sydvest-stat.