Program Pengembangan Sarana dan Prasarana
Pembangunan dan pemeliharaan pelabuhan perikanan
Penguatan fasilitas dermaga, kolam pelabuhan, dan navigasi
Pengadaan dan optimalisasi cold storage, pabrik es, dan gudang beku
Penyediaan SPBN dan sarana BBM nelayan
Penguatan sistem logistik dan rantai dingin
Program Peningkatan Produksi Perikanan
Peningkatan operasional penangkapan ikan
Pengelolaan sentra produksi ikan terukur
Optimalisasi armada dan alat tangkap ramah lingkungan
Peningkatan kualitas dan volume hasil tangkapan
Program Pengolahan dan Nilai Tambah
Pengembangan industri pengolahan hasil perikanan
Peningkatan mutu dan standar keamanan pangan
Diversifikasi produk olahan ikan
Penguatan UMKM perikanan dan industri rumah tangga
Program Pemasaran dan Distribusi
Penguatan akses pasar domestik dan ekspor
Pengembangan sistem pemasaran terintegrasi
Peningkatan distribusi dan konektivitas tol laut
Promosi komoditas unggulan perikanan Natuna
Program Pemberdayaan Nelayan dan SDM
Pelatihan dan peningkatan kapasitas nelayan
Pendampingan usaha dan kelembagaan nelayan
Fasilitasi akses pembiayaan dan asuransi nelayan
Peningkatan peran perempuan dan pemuda pesisir
Program Pengelolaan Sumber Daya dan Lingkungan
Penerapan perikanan berkelanjutan
Pengawasan dan pengendalian aktivitas perikanan
Perlindungan ekosistem laut dan pesisir
Adaptasi perubahan iklim bagi masyarakat nelayan
Program Tata Kelola dan Manajemen Kawasan
Penguatan kelembagaan dan manajemen SKPT
Peningkatan pelayanan dan perizinan terpadu
Digitalisasi data dan sistem informasi perikanan
Monitoring dan evaluasi kinerja SKPT Natuna
Program Keamanan dan Kedaulatan Laut
Sinergi pengawasan laut dengan instansi terkait
Dukungan terhadap pengamanan wilayah perbatasan
Peningkatan kepatuhan hukum di sektor perikanan