毫無疑問，比率分析是最強大的財務分析工具之一。任何想要提高工作效率的投資者都必須投入更多時間來理解比率和比率分析。然而，這並不意味著它沒有局限性。 與所有技術一樣，財務比率也有其限制。了解這些限制將有助於投資者了解比率可能存在的缺陷，並避免這些缺陷。。缺點如下：

誤導性財務報表

比率分析面臨的首要威脅是管理階層故意發布的誤導性陳述。大多數公司管理階層都意識到，投資人非常重視銷售額、收益、現金流等特定數據。財務報表上的其他數據則不會受到如此重視。因此，他們會在法律框架內操縱這些數字，使重要指標看起來更美觀。這在上市公司中很常見，被稱為「粉飾太平」。投資人需要警惕這種粉飾太平的行為，並且必須謹慎計算和解讀基於這些數字的比率。

無可比性

比較是比率分析的關鍵。比率計算出來後，需要與其他公司或不同期間的報表進行比較。然而，很多時候，不同公司的會計政策並不符。這使得任何有意義的比率分析都無法進行。世界各地的監管機構都在努力使財務報表標準化。然而，在許多情況下，公司仍然可以選擇一些會計政策，導致其報表無法比較。

定性因素

跨期比較是比率分析中另一項重要的技術，稱為橫向分析。然而，由於通貨膨脹，跨期比較很多時候毫無意義。兩家公司可能使用同一台效率相同的機器，但其中一家公司的比率會更高，因為它更早以較低的價格購買了這台機器。此外，由於這台機器購買較早，它可能更接近減損。但比率並未反映這一點。

主觀解釋

財務比率是企業營運的既定「經驗法則」。然而，其中一些經驗法則已經過時。因此，當公司採用新的商業模式時，這些比率表明該公司並非理想的投資對象。實際上，這些公司只是「標新立異」而已。許多人甚至稱這些公司為創新公司。對這類公司進行比率分析並不能提供有意義的資訊。投資者必須深入研究才能做出決策。