STIM1

STIM1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2K60, 3TEQ, 2MAJ, 2MAK, 4O9B
Ідентифікатори
Символи	STIM1, D11S4896E, GOK, IMD10, STRMK, TAM, TAM1, stromal interaction molecule 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605921 MGI: 107476 HomoloGene: 20681 GeneCards: STIM1
Пов'язані генетичні захворювання
Stormorken syndrome, tubular aggregate myopathy, combined immunodeficiency due to STIM1 deficiency
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном кальцію • calcium channel regulator activity • microtubule plus-end binding • зв’язування з іоном металу • зв'язування з протеазами • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • інтегральний компонент мембрани • мембрана ендоплазматичного ретикулуму • мембрана • інтегральний компонент плазматичної мембрани • cortical endoplasmic reticulum • sarcoplasmic reticulum • integral component of endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • sarcoplasmic reticulum membrane • мікротрубочка • цитоскелет • клітинна мембрана Біологічний процес • regulation of cardiac conduction • regulation of calcium ion transport • ion transport • detection of calcium ion • enamel mineralization • activation of store-operated calcium channel activity • calcium ion transport • cellular calcium ion homeostasis • regulation of store-operated calcium entry • store-operated calcium entry • positive regulation of angiogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6786	20866
Ensembl	ENSG00000167323	ENSMUSG00000030987
UniProt	Q13586	P70302
RefSeq (мРНК)	NM_003156 NM_001277961 NM_001277962	NM_009287 NM_001374058 NM_001374060 NM_001400557
RefSeq (білок)	NP_001264890 NP_001264891 NP_003147 NP_001369495 NP_001369496 NP_001369497 NP_001369498 NP_001369499 NP_001369500 NP_001369501 NP_001369502 NP_001369503 NP_001369504 NP_001369505 NP_001369506 NP_001369507 NP_001369508 NP_001369509 NP_001369510	NP_033313 NP_001360987 NP_001360989 NP_001387486
Локус (UCSC)	Хр. 11: 3.85 – 4.09 Mb	Хр. 7: 101.92 – 102.09 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

STIM1 (англ. Stromal interaction molecule 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 685 амінокислот, а молекулярна маса — 77 423.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDVCVRLALW		LLWGLLLHQG		QSLSHSHSEK		ATGTSSGANS		EESTAAEFCR
IDKPLCHSED		EKLSFEAVRN		IHKLMDDDAN		GDVDVEESDE		FLREDLNYHD
PTVKHSTFHG		EDKLISVEDL		WKAWKSSEVY		NWTVDEVVQW		LITYVELPQY
EETFRKLQLS		GHAMPRLAVT		NTTMTGTVLK		MTDRSHRQKL		QLKALDTVLF
GPPLLTRHNH		LKDFMLVVSI		VIGVGGCWFA		YIQNRYSKEH		MKKMMKDLEG
LHRAEQSLHD		LQERLHKAQE		EHRTVEVEKV		HLEKKLRDEI		NLAKQEAQRL
KELREGTENE		RSRQKYAEEE		LEQVREALRK		AEKELESHSS		WYAPEALQKW
LQLTHEVEVQ		YYNIKKQNAE		KQLLVAKEGA		EKIKKKRNTL		FGTFHVAHSS
SLDDVDHKIL		TAKQALSEVT		AALRERLHRW		QQIEILCGFQ		IVNNPGIHSL
VAALNIDPSW		MGSTRPNPAH		FIMTDDVDDM		DEEIVSPLSM		QSPSLQSSVR
QRLTEPQHGL		GSQRDLTHSD		SESSLHMSDR		QRVAPKPPQM		SRAADEALNA
MTSNGSHRLI		EGVHPGSLVE		KLPDSPALAK		KALLALNHGL		DKAHSLMELS
PSAPPGGSPH		LDSSRSHSPS		SPDPDTPSPV		GDSRALQASR		NTRIPHLAGK
KAVAEEDNGS		IGEETDSSPG		RKKFPLKIFK		KPLKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, саркоплазматичному ретикулумі.

Література

• Parker N.J., Begley C.G., Smith P.J., Fox R.M. (1996). Molecular cloning of a novel human gene (D11S4896E) at chromosomal region 11p15.5. Genomics. 37: 253—256. PMID 8921403 doi:10.1006/geno.1996.0553
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 doi:10.1021/pr800500r
• Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 doi:10.1038/nbt827
• Lewandrowski U., Moebius J., Walter U., Sickmann A. (2006). Elucidation of N-glycosylation sites on human platelet proteins: a glycoproteomic approach. Mol. Cell. Proteomics. 5: 226—233. PMID 16263699 doi:10.1074/mcp.M500324-MCP200
• Krapivinsky G., Krapivinsky L., Stotz S.C., Manasian Y., Clapham D.E. (2011). POST, partner of stromal interaction molecule 1 (STIM1), targets STIM1 to multiple transporters. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 19234—19239. PMID 22084111 doi:10.1073/pnas.1117231108

Див. також

• Хромосома 11