파일 업로드에 들어간 설정은 들어갈 위치가 마땅치 않아 임시적으로 넣어두었습니다.

해당 설정을 무시하고 서드파티에서도 컨트롤 할 수 있지만 이러한 설정의 전역 설정(?)이 없는것이 어색할 수 있다고 생각하여 추가하였으나 file모듈의 설정부분이 불필요하다고 판단되는 경우 제외하셔도 무방합니다.

말씀하신 것처럼 allow_thumbnail_transparent 설정을 사용하는 곳이 없는 상태이고,
FileHandler::createImageFile()를 호출할 때 결정되므로 이를 사용하는 곳에서 결정될 부분인 것 같습니다.
설정 부분을 제거해주시거나, 여의치 않으시면 제가 제거하여 반영하도록 하겠습니다.

@bnu 확인했습니다. 우선 해당 사항을 분리하고

회원 모듈의 프로필 업로드 시 배경 투명 허용 옵션으로 적용하여 별도 pr 하도록 하겠습니다.

#2243 PR에서 진행