I am interested in gene regulation, lncRNAs, autoimmune disease, evolution and bioinformatics. Founding member of VieRnes de Bioinformatica en el LIIGH (bioinformatics fridays at @LIIGH-UNAM), R-Ladies Morelia and LupusRGMX.

• 🔭 I’m currently working on transcriptomic and genomic data analysis in immune diseases and healthy individuals.
• 💬 Ask me about bioinformatics education
• 📫 How to reach me: ecoss@liigh.unam.mx
• 😄 Pronouns: She/her

• Postdoctoral Fellowship | @LIIGH-UNAM | Dr. @Alejandra Medina-Rivera | February 2023 - Present
• PhD in Plant Biotechnology | @Cinvestav UGA-Langebio, Mexico | Dr. @Selene Fernandez-Valverde | August 2018 - January 2023

• Wellcome Connecting Science
  • Analyzing PBMCs Single Cell ATAC- Seq (scATAC-Seq) and Multiome data: Theory and practice (2024): Webpage | Github
• VieRnes de Bioinformática en el LIIGH-UNAM
  • Conceptos básicos de bioinformática y pseudocódigo (2023): Presentación | Github
  • Manipulación de datos con R (2023): Presentación | Github
  • El ABC de las funciones y loops en R (2023): Presentación | Github
  • Información general del curso e Introducción a R (2024): Presentación | Github
  • Manipulación de datos con R base (vector y dataframe) (2024): Presentación | Github
  • Manipulación de datos con R base (matrix y lista) (2024): Presentación | Github
  • Manipulación de datos con funciones de R base (2024): Presentación | Github
  • Manipulación de datos usando dplyr (2024): Presentación | Github
  • Programacion defensiva con ggplot2 (2024): Webpage | Github
  • Git + Github (2025): Webpage | Github
• Comunidad de Desarrolladores de Software en Bioinformatica (CDSB)
  • Control de calidad en datos de scRNA-Seq (2023: Webpage | Github
• R-Ladies Morelia
  • Curriculum vitae in R (2023): Github
  • R para Análisis Científicos Reproducibles (2024): Github
• RSG-Mexico
  • Workshop Unix Shell (2024): Webpage | Tutorial | Github

• Plants&Python: Webpage | Github | Dr. Daniel H. Chitwood, Dr. Robert VanBuren and Alejandra Rougon-Cardoso
• Transcriptome-guided annotation and functional classification of long non-coding RNAs in Arabidopsis thaliana: paper | Github | Dr. @Selene Fernandez-Valverde
• Rladies-Morelia: Webpage | Github
• Wellcome Connecting Science - Single Cell Genomic Approaches to Study the Immune System - Latin America & the Caribbean: Github
• VieRnes de Bioinformática en el LIIGH-UNAM
  • VieRnes de Bioinformática (22 sep - 9 dic, 2023) Parte0
  • VieRnes de Bioinformática (2 feb - 2 de agosto, 2024) Parte1
  • VieRnes de Bioinformática (7 sep - 6 de dic, 2024) Parte2
  • VieRnes de Bioinformática (7 feb - 6 de junio, 2025) Parte3
• CDSB
  • Creando paquetes de R/Bioconductor para análisis transcriptómicos de célula única (2023): Github
  • Creando paquetes de R/Bioconductor para análisis transcriptómicos de célula única (2024): Github
  • Desarrollo de paqueterías de R/Bioconductor (2024): Webpage | Github
• The Carpentries
  • Introduccion Bash, Python & Github (2022): Webpage
  • Python Programming and Graphing (2024): Webpage
  • Data Analysis - Python, Bash and GIT (2024): Webpage
  • Workshop Unix Shell (2024): Webpage

• Historical contingency drives compensatory evolution and rare reversal of phage resistance: Articulo, Webpage, Github | Puntuación media de reproducibilidad: 9,0/10 | Número de revisoras: 8

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